醫藥衛生領域對于潔凈工程車間的要求是十分嚴格地，但是目前有些醫藥潔凈工程設計并不合理，還存在不少的問題。醫藥潔凈工程車間的關鍵技術主要在于控制塵埃和微生物，作為污染物質，微生物是醫藥潔凈室控制的重中之重。醫藥廠房設備、管道內積聚的污染物質，都可以直接污染藥品，卻毫不影響潔凈度檢測，所以說：GMP需要空氣潔凈技術，而空氣潔凈技術并不代表GMP。

據調查了解，GMP技術改造醫藥廠房潔凈工程普遍存在兩種情況：

1.在污染控制過程中潔凈工程技術應用不利，最終導致有的藥廠投入巨資改造后，藥品質量并未明顯提高。

2.大多數藥廠潔凈室HVAC系統節能效果差，形成不必要的支出，加大了藥品的生產成本。

近年來，我國醫藥行業蓬勃發展，2002年銷售產值為2300億元，每年為潔凈工程技術提供約45億元的市場份額，藥品生產企業的GMP認證更是為“潔凈技術”創造了30億元的商機，顯然，醫藥和醫療衛生已成為當今潔凈工程市場的熱點。

GMP即《藥品生產質量管理規范》，根據《中華人民共和國藥品管理法》的規定制定，是藥品生產質量的基本準則，體現了對藥品生產全過程的控制要求，GMP的要求是強制性的，對生產中影響質量的主要因素提出了基本控制要求，而其中的“生產環境”則還要依靠潔凈工程技術來保證。

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